Согласно отчетам, представленным в Американском обществе, отчеты о состоянии здоровья, полученные в результате генетических тестов, проводимых напрямую для потребителя (DTC) и использующих метод скрининга ограниченных вариантов, часто дают клинические ложноотрицательные результаты, которые создают риск информирования о решениях в области здравоохранения на основе неполной информации. генетики человека (ASHG) Ежегодная встреча 2019 года в Хьюстоне, штат Техас.

Исследователи количественно оценивают ограничения отчетов о состоянии здоровья от прямых генетических тестов до потребителя
                Эдвард Эсплин, MD, Invitae. Кредит: Invitae

Отчеты о состоянии здоровья, полученные в результате генетических тестов DTC, в которых используется подход скрининга ограниченных вариантов, часто дают клинические ложноотрицательные результаты, которые создают риск информирования о решениях в области здравоохранения на основе неполной информации, согласно результатам, представленным на Ежегодное собрание Американского общества генетики человека (ASHG) 2019 года в Хьюстоне, штат Техас.
                                                                                       

Скрининговые тесты с ограниченными вариантами предоставляют информацию о небольшом специфическом наборе генетических изменений или вариантов, которые, как известно, связаны с риском заболевания. Однако каждый ген может иметь тысячи потенциальных вариантов, связанных с заболеванием.

Хотя ограниченные варианты экранов могут быть информативными для обнаруживаемых вариантов, они не предназначены для обнаружения каждого варианта, связанного с рассматриваемой болезнью, пояснил Эдвард Эсплин, доктор медицинских наук из Invitae, который представил исследование. «Таким образом, эти отчеты о состоянии здоровья могут давать ложное чувство уверенности и не должны использоваться для принятия каких-либо медицинских решений без подтверждения тестирования».

Количественная оценка эффективности теста при скрининге риска рака

Управление по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США (FDA) санкционировало маркетинг медицинских отчетов из генетических скринингов DTC для выявления генетического риска рака молочной железы, яичников и колоректального рака.

«Целью нашего исследования было количественное определение клинических ложноотрицательных результатов в результате ограниченной стратегии скрининга и необходимости такого подтверждающего тестирования, чтобы помочь пациентам и их медицинским работникам понять, что делать с результатами для клинической помощи», — сказал он. сказал.

С этой целью д-р Эсплин и его коллеги сосредоточились на двух утвержденных FDA скрининговых тестах с ограниченным вариантом, один на ген MUTYH, который выявляет два варианта, связанных с колоректальным раком, которые распространены среди людей североевропейского происхождения; и один для BRCA1 и BRCA2, который обнаруживает три варианта, связанных с раком молочной железы и распространенных у людей еврейского происхождения ашкенази. Они изучили 270 806 пациентов, которые были направлены медицинскими работниками для генетического тестирования MUTYH, и 119 328, которые были направлены на генетическое тестирование BRCA1/2.

Для обоих тестов они обнаружили, что если бы были проведены только ограниченные варианты скрининга, большинство пациентов получили бы клинические ложноотрицательные результаты. Для MUYTH, 40% людей с мутациями обоих генов MUTYH, что соответствует почти 100% пожизненному риску колоректального рака, было бы пропущено. Еще 22% носителей одной мутации MUTYH, что соответствует 2-кратному увеличению риска колоректального рака, также было бы пропущено. Для BRCA1/2, как и ожидалось, протестированные варианты были значительно более распространены среди евреев-ашкенази. Тем не менее, даже среди этих людей 19% получили бы ложноотрицательный результат, а у 94% не ашкеназских евреев была мутация BRCA1/2, которую можно было бы пропустить.

«Клинический ложноотрицательный результат может быть неверно обнадеживающим, не позволяя пациенту получать необходимую им профилактическую помощь в зависимости от его риска. Это может быть разницей между профилактикой рака и развитием рака», — сказал доктор Эсплин.

Понимание различий между группами населения

Более подробно изучив результаты, команда доктора Эсплина проанализировала частоту ложноотрицательных результатов среди пациентов разных этнических групп. Что касается MUTYH, они обнаружили, что 100% азиатов, 75% афроамериканцев, 46% латиноамериканцев и 33% кавказцев получили бы клинические ложноотрицательные результаты. Аналогичным образом, для BRCA1/2 98% азиатов, 99% афроамериканцев, 94% латиноамериканцев и 94% кавказцев получили бы клинические ложноотрицательные результаты.

Благодаря этим результатам д-р Эсплин подчеркивает медицинскую ценность всестороннего комплексного клинического генетического тестирования в надежде, что благодаря более качественной информации люди получат более широкий доступ к генетическому тестированию и информации, которая может улучшить принятие решений в области здравоохранения. Он также надеется, что его работа приведет к доступу к генетическому тестированию клинического уровня в качестве профилактической меры, даже для людей, у которых нет семейной истории болезни.

«Результаты этого типа генетического скрининга DTC могут быть неверными, но они крайне неполны, особенно если смотреть на вопрос о состоянии здоровья, который может задавать пациент — я подвержен риску рака. Мы надеемся, что наше исследование подчеркивает необходимость для потребителей, чтобы понять глубокие ограничения этих отчетов о состоянии здоровья и искать соответствующие клинические генетические тесты, пытаясь понять их риск заболеваний, таких как рак «, сказал д-р Эсплин.